货物或卸完货物后，必须停留在港口，等待与其他船只编成护航船队，这样既浪费了时间又减低了船舶运载量。
但事实胜于雄辩，护航运输船队体制的实行，大大降低了船只的损失，在战争爆发后的四个月中，编入护航运输船队的5756艘船只中，只有12艘被击沉，而且这12艘中还有5艘是在掉队的情况下被击沉的。
而同一时间里单独航行的船只有102艘被击沉。
这一阶段，英国共损失运输船114艘，计42.3万吨。
战争初期，英国的反潜措施除了采取护航运输船队体制以外，就几乎没有其他有效的措施了。
航母编队的攻击性反潜战术，因“勇敢”号被击沉而夭折；反潜飞机装备的MKⅠ型雷达性能欠佳，只能发现5000米外水面状态航行的潜艇。
在能见度好的情况下，潜艇甚至通过目视观察能先发现飞机！
而且反潜飞机由于使用的炸弹性能不佳，投向潜艇后反而会被水面反弹到空中爆炸，对飞机所造成的损害竟然更甚于对潜艇的损害！
有2架飞机就这样被自己的炸弹所击落。
加之反潜飞机数量严重不足，英国只得采取“稻草人”战术，即征用大量民间飞行俱乐部无武装的飞机，沿海岸飞行，以迫使德军潜艇下潜，并及时发现被击沉的运输船，这种落后的战术竟然一直使用到1940年5月法国沦陷后。
要使反潜飞机真正在作战中发挥作用，不仅要对炸弹进行改装，还要安装轰炸瞄准具和新型的探测仪，完成这些工作至少需要一年的时间。
为了弥补护航舰只的不足，英国开始加紧建造轻型护卫舰，这种护卫舰排水量在2000吨以下，装备火炮、深水炸弹和声纳，在武装拖网渔船和其他小型舰艇的支援下，是一种能在近岸海域有效进行反潜作战的舰艇。
在1939年9月至1940年5月的第一阶段中，德军由于种种原因限制，主要采取的是单艇作战，邓尼兹还是按照战前的设想开始进行集群作战的尝试性实验。
第一次是1939年10月中旬，出动6艘潜艇，结果其中1艘在英吉利海峡触雷沉没，2艘在攻击护航运输船队中被击沉，因此集群作战实验没有成功。
同时组织潜艇在英国海岸附近海域进行了大面积布雷，所布的水雷先后炸沉12艘船只炸伤6艘，损失船只的吨位达12万吨。
1939年11月中旬，邓尼兹再次出动4艘潜艇进行集群作战尝试，U—53号潜艇发现了KS—27护航运输船队，尽管多次遭到英军护航军舰和水上飞机的压制和驱赶，但仍一直保持着与船队的接触，并引导其他3艘潜艇赶来。
但因种种原因没能达成集群攻击，潜艇只对掉队的船只进行了
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